V geomorfologickom celku Hornonitrianska kotlina sa nachádza celkom 8 jaskýň (údaj k 31.12.2017). Z toho v podcelku Prievidzská kotlina je to 5 jaskýň a v podcelku Handlovská kotlina sú to 3 jaskyne.
Podcelok Prievidzská kotlina
Bojnická hradná jaskyňa (Studňa)
Cickova jaskyňa
Jaskyňa vo farskej záhrade (Puklinová jaskyňa vo farskej záhrade)
Prepoštská jaskyňa
Previs v skale (Hajzel)
Podcelok Handlovská kotlina
Gertrúda
Jánošíkova jaskyňa
Líščia diera