Územie okresu Nitra zasahuje 1 chránená krajinná oblasť a 2 chránené vtáčie územia. CHKO Ponitrie CHVÚ Tribeč CHVÚ Žitavský luh
Na území okresu Nitra sa nachádza 9 území európskeho významu. Bábsky les (SKUEV0869) Dvorčiansky les (SKUEV0176) Gýmeš (SKUEV0131) Lupka (SKUEV0879) Malý Bahorec (SKUEV0877) Mochovská cerina (SKUEV0867) Patianska cerina (SKUEV0882) Vinodolský háj (SKUEV0126) Zobor (SKUEV0130)
Na území okresu Nitra sa nachádzajú 2 národné prírodné rezervácie, 2 prírodné rezervácie, 2 prírodné pamiatky a 9 chránených areálov. Bábsky les Bábsky park Huntácka dolina Jelenská gaštanica Klasovský park Lapášsky park Lupka Nitriansky dolomitový lom Novoveský park Rumanovský park Svoradova jaskyňa Šuriansky park Zoborská lesostep Žibrica Žitavský park
Za chránený strom bol vyhlásený v roku 1996. Mohutný brest väzový s výškou 25m, obvodom kmeňa 356cm, priemerom koruny 16m a vekom viac ako 170 rokov. Významný exemplár je chránený z kultúrnych, historických, vedeckých, krajinotvorných, krajinárskych, ekologických a estetických dôvodov. Nachádza sa v obci Veľká Dolina pred obecným úradom.
Za chránený strom bola vyhlásená v roku 1977 a 1996. Lipa veľkolistá s výškou 15m, obvodom kmeňa 526cm, priemerom koruny 20m a vekom viac ako 220 rokov. Významný exemplár je chránený z historických, estetických a krajinárskych dôvodov. Takéto stromy je potrebné evidovať a chrániť. Nachádza sa v obci Štitáre v časti Dolné Štitáre pri kostole na cintoríne.
Národná kultúrna pamiatka vyhlásená v roku 1984. Neskorobarokový kamenný cestný most, tzv. turecký most, z konca 18.storočia. Nachádza sa pri ceste do Veľkých Chyndíc neďaleko obce v údolí Drevenice.