Na území okresu Bratislava II sa nachádzajú 3 územia európskeho významu. Biskupické luhy (SKUEV0295) Hrušov (SKUEV0270) Malý Dunaj (SKUEV0822)
Na území okresu Žiar nad Hronom sa nachádza 8 území európskeho významu. Bujačia lúka (SKUEV0640) Dolný Chlm (SKUEV0892) Horná skala (SKUEV0858) Klokoč (SKUEV0264) Kunešovské lúky (SKUEV0893) Stredný tok Hrona (SKUEV0947) Suť (SKUEV0265) Vtáčnik (SKUEV0273)
Na území okresu Žarnovica sa nachádza 10 území európskeho významu. Hodrušská hornatina (SKUEV0263) Klokoč (SKUEV0264) Revištský rybník (SKUEV0638) Sokolec (SKUEV0593) Stráž (SKUEV0013) Stráž (SKUEV1013) Stredný tok Hrona (SKUEV0947) Suť (SKUEV0265) Tomov štál (SKUEV0023) Vtáčnik (SKUEV0273)
Na území okresu Zvolen sa nachádza 9 území európskeho významu. Boky (SKUEV0245) Dolná Zálomská (SKUEV0856) Gavurky (SKUEV0201) Hrbatá lúčka (SKUEV0249) Mláčky (SKUEV0186) Poľana (SKUEV0319) Repiská (SKUEV0008) Skalka (SKUEV0266) Suť (SKUEV0265)
Na území okresu Veľký Krtíš sa nachádza 12 území európskeho významu. Alúvium Ipľa (SKUEV0257) Cúdeninský močiar (SKUEV0054) Čebovská lesostep (SKUEV0035) Dedinská hora (SKUEV0261) Galamia (SKUEV0959) Ipeľské hony (SKUEV0055) Kiarovský močiar (SKUEV0053) Litava (SKUEV0036) Ľuborečské dubiny (SKUEV0956) Rataj (SKUEV0865) Seleštianska stráň (SKUEV0052) Stredný tok Ipľa (SKUEV0958)
Na území okresu Rimavská Sobota sa nachádza 22 území európskeho významu. Beležír (SKUEV0360) Cerová vrchovina (SKUEV0357) Cerová vrchovina (SKUEV1357) Cerová vrchovina (SKUEV2357) Dechtárske vinice (SKUEV0359) Drienčanský kras (SKUEV0366) Drienčanský kras (SKUEV2366) Drieňové (SKUEV0669) Hubovo (SKUEV0814) Klenovské Blatá (SKUEV0384) Klenovský Vepor (SKUEV0200) Muránska planina (SKUEV0225) Pieskovcové chrbty (SKUEV0362) Pieskovcové chrbty (SKUEV1362) Pokoradzské jazierka (SKUEV0364) Rimava (SKUEV0003) Rimava a Slaná (SKUEV0817) Rosiarka (SKUEV0729) Ťahan (SKUEV0363) Tisovský kras (SKUEV0282) Tŕstie (SKUEV0281) Vodokáš (SKUEV0361)